殺老師和3年E班『上課的一年』，用登上大螢幕的方式回來了！
讓粉絲讚不絕口，引起絕大迴響的動畫，用淚水上完最後一課「感謝」…
今年秋天，只有在劇場版才看得到的原創故事，還有每天3年E班和殺老師一起度過的喜怒哀樂，以及畢業前夕下定決心的告別，都將再次活躍於大螢幕上！
　　史上最危險的超生物「殺老師」，既炸完月球後又想炸掉地球，以不明目的擔任起椚丘中學 3 年 E 班的導師。擁有超人類智慧的「殺老師」，連軍隊也動不了他一根汗毛，於是各國首腦配送特製武器，附以高酬勞委託放牛班學生們在一年內殺掉他！
　　同學們個個想盡辦法使出渾身解數要暗殺老師阻止地球毀滅，接受了各種訓練，逐漸與同伴培養出深厚友誼，不僅對自己產生信心，也和「殺老師」有了特別的情感，更發現了「殺老師」的秘密，他們能否趕在畢業前，成功執行「殺老師」的暗殺任務呢……?