身材矮小、紅色捲髮、滿臉雀斑的「瑪麗」，是個開朗又充滿活力的少女。但她也有點笨手笨腳，做什麼事情都不太順利，平凡的瑪麗與同年齡的少女一樣，對於自己的未來抱持小小的煩惱。不過在一個永生難忘的夏天，因為奇妙的契機，瑪麗被捲入了意想不到的冒險旅途……

　　十一歲那年，瑪麗在夏洛特老奶奶鄉下的老房子度過暑假。一日她在附近森林散步時，遇到了毛色純黑的小貓提夫。提夫引領瑪麗走入森林深處，見到七年才會綻放一次的神祕之花「夜間飛行」。瑪麗不經意將「夜間飛行」的花粉沾上老房庭院的舊掃帚，將平凡無奇的掃帚變成了魔法飛杖，乗上魔法飛杖的瑪麗升空高飛，她將抵達的所在，竟是不可思議的魔女學校。如果只有一夜，少女獲得了魔女之力，她的生命將會邂逅出怎樣的感動奇蹟？